Centralne Laboratorium Kliniczne
 Klinika Chorób Nerek i Nadciśnienia Dzieci i Młodzieży
 Klinika Alergologii
 Klinika Dermatologii, Wenerologii i Alergologii
 Klinika Gastroenterologii i Hepatologii
 Klinika Kardiologii Dziecięcej i Wad Wrodzonych Serca
 Klinika Neurologii Dorosłych

 Klinika Neurologii Rozwojowej
 Kliniki Onkologii i Radioterapii

 Kliniki Okulistyki

 Kliniki Rehabilitacji
 Laboratorium Immunologii i Transplantologii Klinicznej
 Laboratorium Genetyki Klinicznej UCML
 Laboratorium Mikrobiologii Klinicznej UCML
 Laboratorium Patomorfologii Klinicznej
 Laboratorium Hematologii
 Zakład Diagnostyki Chorób Serca i Naczyń
 Zakład Radiologii
 Zakład Medycyny Nuklearnej
 Regionalne Centrum Diabetologii

 Pracownia Densytometrii